چند ماه پس از اعلام موجودیت «مجمع ملی برای نجات افغانستان»، جبهه مقاومت ملی افغانستان و جمعیت اسلامی با نشر اعلامیه‌های جداگانه، از عدم مشارکت خود در تصمیمات و ساختار این مجمع خبر داده‌اند.
هر دو جریان سیاسی در اعلامیه‌هایی مشابه تأکید کرده‌اند که از آغاز شکل‌گیری این مجمع، نگرانی‌های جدی سیاسی و تخنیکی نسبت به ساختار، پالیسی‌ها و شیوه مدیریتی آن داشته‌اند و این نگرانی‌ها را در مشورت با متحدان و بزرگان سیاسی کشور نیز مطرح کرده‌اند.
در اعلامیه‌ها آمده است که رعایت‌نشدن این ملاحظات، نه‌تنها به سود مردم نیست، بلکه می‌تواند موجب تضعیف جریان‌ها و سازمان‌های جدی مخالف طالبان نیز شود.
جبهه مقاومت ملی و جمعیت اسلامی، تأکید کرده‌اند که مبانی سیاسی و مردمی آنان از طریق این مجمع قابل حفظ نبوده و به همین دلیل، هیچ‌گونه دخالتی در تصمیم‌گیری‌ها و انتخاب‌های این مجمع نداشته‌اند.
