خالد زدران، سخنگوی فرماندهی پولیس طالبان در کابل، تأیید کرده است که فرخنده، دختر ۱۷ ساله، به‌گونه‌ای مشکوک جان باخته است. به گفتهٔ او، خانوادهٔ این دختر علت مرگ را «سکتهٔ مغزی» عنوان کرده‌اند.

با این حال، روایت‌ گروه‌های مدافع حقوق زنان با اعلامیهٔ طالبان متفاوت است. جنبش «زنان آزادی‌خواه» در بیانیه‌ای گفته است که فرخنده از حق آموزش محروم بوده و تنها ۴۵ روز از ازدواج اجباری او می‌گذشت. بنا بر این گزارش، پیکر او صبح ۱۵ نوامبر در خانهٔ شوهرش در منطقهٔ گلبهار سنتر کابل پیدا شده و مرگ او «طبیعی یا تصادفی» تلقی نمی‌شود.

این جنبش مدعی است که خانوادهٔ فرخنده درخواست انتقال جسد به طب عدلی برای بررسی علت واقعی مرگ را داشتند، اما «حاجی احسان‌الله» شخصی بانفوذ و قدرتمند که گفته می‌شود از فعالیت‌های اقتصادی در بخش معادن نفوذ قابل توجهی دارد مانع انجام بررسی‌های طبی شده و با فشار و تهدید، خانواده را به سکوت واداشته است.

در بیانیهٔ این گروه آمده است که این رویداد «نمونه‌ای از وضعیت نگران‌کنندهٔ حقوق زنان در افغانستان» است؛ وضعیتی که در آن، به گفتهٔ آنان، زنان نه امکان شکایت دارند و نه دسترسی به عدالت. این جنبش تأکید کرده است که فرخنده نماد شمار زیادی از دخترانی است که به دلیل خشونت، تعصب و نبود سازوکارهای حمایتی قربانی می‌شوند.

خانوادهٔ فرخنده تاکنون به‌صورت مستقل در مورد ادعاهای مطرح‌شده اظهارنظر نکرده‌اند و مقام‌های طالبان نیز جزئیات بیشتری دربارهٔ چگونگی مرگ این دختر ارائه نداده‌اند.

تحقیقات مستقل در این پرونده تاکنون آغاز نشده و فعالان حقوق زنان خواستار پیگیری شفاف این رویداد شده‌اند.